Отсчет истории кафедры экономики и экономической безопасности начался с создания кафедры бухгалтерского учета и аудита, которая была образована приказом ректора УГЛТА от 18 марта 1998 года № 38-А.
Костяк новой структуры составили преподаватели, воспитанные кафедрой экономики и организации лесного комплекса.
Первым заведующим кафедрой был избран Колесников Сергей Иванович, к.э.н., доцент.
В течение 15 лет кафедра вела подготовку студентов по специальности «Бухгалтерский учет, анализ и аудит». За это время было выпущено более 850 экономистов по данной специальности.
При переходе на двухуровневое высшее образование (бакалавриат-магистратура) кафедре пришлось перепрофилироваться на подготовку выпускников по специальности «Экономическая безопасность».
В связи с этим приказом ректора УГЛТУ от 12 декабря 2011 года № 311-А кафедра была переименована в кафедру бухгалтерского учета, анализа и экономической безопасности.
С 1 сентября 2012 года университет начал прием студентов на новую специальность, а в июне 2017 года кафедра выпустила первых специалистов-экономистов по экономической безопасности.
В 2017 году в связи с оптимизацией образовательной структуры университета в состав кафедры вошли преподаватели кафедр экономики лесного бизнеса и экономики транспорта и логистики. Приказом ректора УГЛТУ от 14.07.2017 года № 166-А кафедра была преобразована в кафедру экономики и экономической безопасности.